- Dezernat 11: Theologie, Gottesdienst, Kirchenmusik
Dezernent: Dr. Vicco von Bülow
- Dezernat 12: Diakonie, Seelsorge, Missionarische Dienste
Dezernentin: Doris Damke
- Dezernat 13: Kirchenordnung und Kirchenrecht
Dezernent: Dr. Hans-T. Conring
- Dezernat 21: Gesellschaftliche Verantwortung, Öffentlichkeitsarbeit und Publizistik
Dezernent: Albert Henz
- Dezernat 22: Weltmission und Ökumene, Kirchlicher Entwicklungsdienst
Dezernent: Dr. Ulrich Möller
- Dezernat 23: Verwaltungsausbildung und Rechtsangelegenheiten
Dezernent: Dr. Thomas Heinrich
- Dezernat 31: Vorbereitungs- und Entsendungsdienst, Pfarrdienst, Personalplanung, Theologische Fortbildung
Dezernentin: Petra Wallmann
- Dezernat 32: Theologische Ausbildung, Hochschulangelegenheiten, Gemeindebezogene Dienste
Dezernentin: Dr. Johanna Will-Armstrong
- Dezernat 34: Dienst- und Arbeitsrecht
Dezernent: Henning Juhl
- Dezernat 41: Bildung und Erziehung
Dezernent: Fred Sobiech
- Dezernat 42: Schulwesen
Dezernent: Dr. Wolfram von Moritz
- Dezernat 43: Schul- und Bildungsrecht
Dezernent: Werner Prüßner
- Dezernat 51: Finanz- und Vermögensverwaltung sowie Bau- und Grundstücksangelegenheiten der Kirchengemeinden und Kirchenkreise, Verwaltungsorganisation, Friedhofs-, Liegenschaftsangelegenheiten
Dezernentin: Martina Deutsch
- Dezernat 61: Haushalt und Finanzen
Dezernent: Klaus Winterhoff
- Dezernat 62: Steuerwesen, Mitgliedschaft, IT und Statistik
Dezernent: Dr. Arne Kupke
- Gehaltsabrechnungsstelle
Leiter: Dieter Kotkowski
- Referat 53: Baureferat
Leiter: Reinhard Miermeister
- Referat 63: Landeskirchliches Archiv
Leiter: Dr. Jens Murken
- Verwaltungsreferat
Verwaltungsdirektor: Günter Wulf
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